Природний фільтр
Площа болотної системи порівнянна з територією деяких європейських держав. Швейцарія займає 4,1 млн га, а Васюганське болото 5,5 млн га. Водно-болотні угіддя розкинулися на територіях Томській, Новосибірській і Омській областей і щорічно розширюються на 0,8 км2.
Запаси торфу складають більше 1 млрд тонн з глибиною до 10 метрів. Це природний фільтр, що протидіє парниковому ефекту. Завдяки торф`яним запасам болото поглинає з атмосфери токсичні елементи і акумулює вуглекислий газ. Одне тільки Васюганское болото містить 12% вуглецевих запасів всього Західно-Сибірського регіону. За рік з атмосфери поглинається до 10 млн тонн вуглекислого газу.
Одночасно з цим болотна рослинність виділяє до 4 млн тонн кисню на рік. Тут ростуть зникаючі, рідкісні та цінні види рослин, міститься великий запас лікарських трав. З дикоросів багато морошки, лохини, журавлини.
Васюганське болото - джерело прісної води: тут 800 тис. Озер, з боліт течуть ріки. На території водно-болотних угідь мешкають рідкісні тварини: сапсан, північний олень, скопа, беркут, орлан-білохвіст, сірий сорокопуд. Тут багато рябчиків, глухарів, білок, соболів, лосів, куріпок, тетеруків. Рідше зустрічаються росомаха, видра і норка.
Територія під особливою увагою
Експлуатація газових і нафтових родовищ ставить під загрозу рослинний і тваринний світ регіону. Також на ці території падають частини ракет-носіїв, що стартують з Байконура. Вони містять залишки гептилу, що представляє екологічну небезпеку. Територія потребує особливої уваги та охорони.
У 2006 році 10% площі Великого Васюганського болота увійшло в державний ландшафтний заказник. У 2007 році його включили до попереднього списку Всесвітньої природної спадщини ЮНЕСКО.
Почесний громадянин Каргасокского району Томської області, керівник мережі фенологических спостерігачів В.Г. Рудська виступив з ідеєю створення віртуального музею, присвяченого Великому Васюганське болото, і проект реалізували. Також в Томській області відкрито музей торфу.